Seit 1990 (seit 1998 als freier Mitarbeiter) ist Eckart Hübner Solofagottist im SWR Sinfonieorchester (früher SWF). In dieser Zeit war vor allem die Zeit unter dem Chefdirigenten Michael Gielen prägend.

Weltweit anerkannte Aufnahmen und Konzerte – auch und gerade im Bereich der Neuen Musik – führen in diesem Klangkörper dazu, dass es keinen gewöhnlichen Orchesteralltag gibt.